Kegiatan bimbingan karier merupakan bagian dari pelayanan pada perencanaan individual yang terdapat pada program dan konseling SMA Muhammadiyah 5 Yogyakarta. Pelaksanakan pelayanan bimbingan dan konseling dilaksanakan melalui tatap muka dengan pembagian setiap kelas dengan menggunakan protokol kesehatan yang sudah memadai dan juga yang tidak berangkat difasilitasi melalui aplikasi Zoom agar semua mendapatkan pelayanan bimbingan karier. Pelaksanakan bimbingan Karier dilaksanakan 1 bulan dari bulan Februari sampai bulan Maret. Pelaksanakan bimbingan karier dilaksanakan dalam rangka memberikan arahan dan gambaran untuk pemilihan jurusan nanti pada saat mendaftar Universitas yang diinginkan oleh peserta didik.
Kegiatan pelayanan bimbingan karier untuk kelas 12 diikuti oleh jurusan IPA terlebih dahulu dan dilanjutkan oleh IPS. Materi yang disampaikan berupa materi cara pendaftaran Perguruan Tinggi Negeri maupun Swasta yang diingnkan, Jalur masuk Perguruan tinggi dan Penugasan dengan menuliskan harapan harapan yang diinginkan oleh peserta didik.
Harapannya setelah mengkuti kegiatan ini, peserta didik SMA Muhammadiyah 5 Yogyakarta khususnya kelas 12 yang mampu membuat keputusan karir yang benar benar ingin diinginkan berdasrakan bakat dan minat yang dimiliki siswa kelas 12. Peserta didik juga wajib bertanggung jawab atas pilihann yang sudah dipilih agar tidak menyesal di kemudian hari.